Stray Cat Wrote:
Именно так. В прогшлом году говорили что их этак штук 60 вроде бы, всяких разных.
Но "ужасную болезнь" назвали именно "коронавирус". Что УЖЕ само по себе как минимум странно.
нет, это называется коронавирусная инфекция COVID-19, инфекционное заболевание вызванное вирусом SARS-CoV-2 (Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2)
Цифра два, потому что
https://www.lvrach.ru/2003/09/4530710 Quote:
Возбудитель SARS — один из представителей коронавирусов. Он был идентифицирован 17 марта 2003 г. По материалам ВОЗ было установлено, что возбудитель SARS представляет собой новый тип коронавируса.
Коронавирусы — крупные РНК, содержащие вирусы, способные вызывать заболевания у людей и животных. По антигенным свойствам разделяются на три группы. К первой принадлежат респираторный коронавирус человека 229Е, коронавирусы кошек, собак, свиней. Ко второй — человеческий вирус ОС43, вирус гепатита мышей и коронавирус телят. Третья группа включает в себя кишечные коронавирусы человека и вирусы инфекционного бронхита птиц.
Официально установлено, что SARS вызывает новый коронавирус, который ранее никогда не встречался у человека и животных. Новый вирус назвали SARS-ассоциированным коронавирусом. Изображение его получено с помощью электронной микроскопии.
Вирионы имеют сферическую форму диаметром 80–160 нм. Поверхность вириона покрыта булавовидными отростками, длиной около 20 нм, придающими вирионам форму короны.
Вирионы содержат плюс-цепь полиаденилированной РНК длиной 16–30 kb (коронавирусы обладают самым большим геномом, превосходящим геном других вирусов в три раза). Геномная нить (+) РНК коронавирусов, состоящая из одной цепочки, способна транслироваться на рибосомах клетки хозяина. Вирионы образуются почкованием от мембран шероховатого эндоплазматического ретикулума или аппарата Гольджи. Зрелые вирионы формируются внутри клеток до того, как вирусные белки будут экспрессированы на поверхности клеток. Вышедшие вирионы способны вновь сорбироваться на поверхности клеток, вызывая их слияние и стимулируя иммунный ответ хозяина. Основными клетками-мишенями являются клетки альвеолярного эпителия.
Атипичная пневмония (SARS). Этиология, патогенез, клиника, статистика (06.05.2003)
http://www.fesmu.ru/www2/poltxt/u0010/pulmcl/5/sars1.htmQuote:
Проблема распространения атипичной пневмонии (точнее тяжелый острый респираторный синдром SARS) приобрела глобальный характер. В принципе ничего удивительного нет: степень коммуникации в современном мире, мутации бактерий и вирусов давно благополучно способствуют таким процессам. И, если с атипичными пневмониями в целом, есть полная ясность (см. Главу IV настоящего материала –прим.ред.).
Геном бетакоронавируса SARS-CoV-2
https://biomicsj.ru/upload/iblock/7e6/bmcs2020122242.pdfQuote:
Прежде чем приступить к описанию организации генома нового бетакоронавируса, следует коротко остановиться на прочих коронавирусах человека и их таксономии. До появления SARS-CoV-2 были известны шесть таких коронавирусов, относящихся к альфакоронавирусам (HCoV-229E и HCoV-NL63) и бетакоронавирусам (HCoV-OC43, HCoV-HKU1, SARS-CoV, MERS-CoV). Обнаружение первого коронавируса датировано серединой 1960-х гг., а последнего из этого списка -2012 г. И теперь, спустя несколько лет, стало известно о новом бетакоронавирусе SARS-CoV-2. Все они имеют схожую организацию генома, представленного содержащей на 5'-конце метилгуанозиновый кэп единой последовательности нуклеотидов в виде (+)-цепи РНК с размерами от 27 до 32 тысяч нуклеотидов, что превосходит таковые у остальных РНК-вирусов с несегментированными геномами. GC-состав геномной РНК коронавирусов колеблется около 40%. Размер вирионов оболочечных бетакоронавирусов составляет около 120 нм в диаметре. Согласно последней номенклатуре вирусов (https://ictv.global/taxonomy/), коронавирусы относятся к реалму Riboviria и входят в порядок Nidovirales,семейство Coronaviridae, которое состоит из двух подсемейств Letovirinae и Orthocoronavirinae.
Последнее подсемейство включает четыре рода Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Deltacoronavirus и Gammacoronavirus. Наиболее опасные виды MERS-
CoV, SARS-CoV и SARS-CoV-2 из рода Betacoronavirus относятся - первый к подроду Merbecovirus, а два вторых – к подроду Sarbecovirus.
MERS-CoV оказался наименее контагиозным среди них и поразил всего около двух с половиной тысяч человек, но при этом характеризовался очень высокой летальностью, в отдельных популяциях приближающейся к 40%. Но этот вирус за небольшими исключениями останется за пределами рассмотрения в данной статье по той причине, что рецептором для него служит дипептидилпептидаза 4, тогда как и SARS-CoV, и SARS-CoV-2 нацелены на
ангиотензин-превращающий фермент 2 (ACE2) человека.
Taxonomic Classification
Quote:
The process used to study any new biological entity begins by classifying it in relation to other known biological organisms, and then giving it a name.
This process of classification and naming comprises the discipline of taxonomy, and has been an integral part of biological research since at least the 18th Century when Carl Linnaeus defined the principles of modern taxonomy. Taxonomic classification is a scientific endeavor whereby biological organisms are grouped together and placed into their proper taxonomic hierarchy based on the characteristics that form a unique descriptor identifying a particular organism. This research process is driven by individual scientists who publish their work, providing their evidence for the proposed classification. As new data are obtained either on the organisms previously studied, or on related organisms, the classification hierarchy may change. The principles, procedures, and nomenclature used to name taxa, is handled by one of the international organizations charged with developing the necessary guidelines. For example, naming of animal species is subject to the principles established by the International Commission on Zoological Nomenclature. Naming of bacterial species is guided by the International Committee on Systematic Bacteriology.
Virus Classification
Classification of viruses is based on the collection and comparison of various characters that describe the virus, and can then be used to distinguish one virus from another. Characters can consist of any property or feature of the virus, and include the molecular composition of the genome; the structure of the virus capsid and whether or not it is enveloped; the gene expression program used to produce virus proteins; host range; pathogenicity; and sequence similarity. While all characters are important in determining taxonomic relationships, sequence comparisons using both pairwise sequence similarity and phylogenetic relationships have become one of the primary sets of characters used to define and distinguish virus taxa.
Based on an assessment of characters, a hierarchical relationship is established that groups together viruses with similar properties. The properties that define higher-level taxa are shared with all lower-level taxa that belong to higher-level taxa. For example, viruses of the order Picornavirales are all non-enveloped, icosahedral particles containing one or two segments of positive-sense RNA. The family Picornaviridae is one of several families belonging to the order Picornavirales. Members of the family Picornaviridae contain a single monocistronic genome with conserved genome organization (arrangement of encoded polypeptides). Members of the genus Enterovirus (family Picornaviridae) share more than 42% amino acid identity across the length of their polyprotein. Finally, members of the species Enterovirus C, share a limited range of hosts and host receptors, have similar polyprotein processing programs, and share more than 70% amino acid identity in the polyprotein. Once these criteria for grouping similar viruses into common taxa are established, they are used as demarcation criteria to determine if newly discovered viruses are members of an existing species (and therefore also in existing higher-level taxa), or if the new viruses warrant creation of a new species (and potentially new higher-level taxa), if their properties are sufficiently distinct from the viruses in an existing species.
The ICTV
The first internationally organized attempts to introduce order into the bewildering variety of viruses took place at the International Congress of Microbiology held in Moscow in 1966. A committee was created, later called the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), and was given the task of developing a single, universal taxonomic scheme for all the viruses infecting animals (vertebrates, invertebrates and protozoa), plants (higher plants and algae), fungi, bacteria and archaea. The ICTV was created as a committee of the Virology Division of the International Union of Microbiological Societies (IUMS) and is governed by Statutes approved by the Virology Division. The Statutes define the objectives of ICTV: (i) to develop an internationally agreed taxonomy for viruses (the term “viruses” for this purpose is taken to include viroids and some important groups of satellite viruses); (ii) to develop internationally agreed names for these taxa; (iii) to communicate taxonomic decisions to the international community of virologists; and (iv) to maintain an index of virus names. The Statutes also state that classification and nomenclature of viruses will be subject to rules set out in an International Code. Virus taxonomy differs from other types of biological classification because the ICTV not only regulates a Code of Nomenclature but also considers and approves the creation of virus taxa. Priority of publication is not the determining factor.
The working of the ICTV
The ICTV Executive Committee (EC) has established over 100 international Study Groups (SGs) covering all virus taxa. The Chair of each SG is appointed by the relevant Subcommittee Chair, who is a member of the EC. Each subcommittee is responsible for classes of viruses with different genome configurations infecting different hosts. The current subcommittees encompass Archaeal Viruses, Animal DNA Viruses and Retroviruses, Animal dsRNA and ssRNA- Viruses, Animal ssRNA+ Viruses, Bacterial Viruses, Fungal and Protist Viruses, and Plant Viruses. SG Chairs are responsible for (i) organizing discussions among SG members of emerging taxonomic issues in their field, (ii) overseeing the submission of proposals for new taxonomy, and (iii) preparing or revising relevant chapter(s) in ICTV Reports.
Virus Metadata Resource (VMR)
The VMR provides a list of exemplar viruses for each species recognized by the ICTV and links to their genomic sequence.
Select this link for a table providing information on and access to every ICTV taxonomy release since MSL #1 in 1971.
https://talk.ictvonline.org/taxonomy/